Trámites para abrir una farmacia en México: checklist de permisos COFEPRIS

Abrir una farmacia no es solo conseguir el local y surtir el anaquel. Antes de vender el primer medicamento tienes que estar en regla ante la autoridad sanitaria. La buena noticia es que los trámites siguen un orden lógico y, hoy, buena parte se hace en línea. Esta guía es una orientación práctica para que sepas qué esperar y en qué orden avanzar; no sustituye la asesoría de un profesional ni el detalle del portal oficial, que es donde debes confirmar cada requisito.

Primero lo básico: qué depende de COFEPRIS y qué no

Conviene separar dos mundos que suelen confundirse. Por un lado están los trámites sanitarios, que dependen de la Comisión Federal para la Protección contra Riesgos Sanitarios (COFEPRIS): son los que te habilitan para operar una farmacia como establecimiento con actividad de riesgo sanitario. Por el otro están los trámites municipales y estatales, como el uso de suelo, la licencia de funcionamiento del municipio, el alta ante el SAT o Protección Civil. Estos últimos son aparte, no los tramitas en COFEPRIS y varían según tu ciudad. En esta guía nos enfocamos en la parte sanitaria, que es la que aplica igual en todo el país.

Aviso de Funcionamiento ante COFEPRIS

El primer trámite sanitario de una farmacia es el Aviso de Funcionamiento. Se presenta ante COFEPRIS para los establecimientos que realizan una actividad de riesgo sanitario, y una farmacia entra en ese supuesto. En términos prácticos, es el aviso con el que le dices a la autoridad que ese domicilio va a operar como establecimiento de venta de medicamentos. Hoy muchos de estos trámites se realizan en línea a través de la plataforma DIGIPRIS, el portal digital de la autoridad sanitaria, lo que evita buena parte del papeleo presencial. El detalle exacto de requisitos y campos lo confirmas siempre en el portal oficial de COFEPRIS/DIGIPRIS.

Aviso de Responsable Sanitario

Junto con el Aviso de Funcionamiento va el Aviso de Responsable Sanitario. La farmacia debe designar a una persona con el perfil profesional que exige la normativa para responder por el manejo correcto de los medicamentos. Este aviso acompaña al de funcionamiento y forma parte del mismo bloque inicial de trámites. Es un dato que la autoridad quiere tener claro desde el arranque: quién es el responsable de que la operación sanitaria se lleve como debe ser. Si ese responsable cambia con el tiempo, el aviso se actualiza.

¿Vas a manejar medicamentos controlados? Entonces Licencia Sanitaria

Aquí está la bifurcación más importante. Si tu farmacia va a vender únicamente medicamentos de venta libre y de venta con receta común, el Aviso de Funcionamiento y el de Responsable Sanitario cubren el arranque. Pero si vas a manejar estupefacientes o psicotrópicos —los llamados medicamentos controlados— el requisito sube de nivel: necesitas Licencia Sanitaria, un permiso más estricto que el simple aviso.

Esto no es un tecnicismo lejano. Desde el 14 de julio de 2026, el tramadol es un medicamento controlado de Fracción III según el artículo 245 de la Ley General de Salud. Es decir, un analgésico muy común pasó a la lista de controlados, y cualquier farmacia que lo maneje queda dentro del supuesto que exige licencia sanitaria y su control correspondiente. Antes de decidir si manejarás controlados, ten claro que implica un permiso adicional y obligaciones de registro más estrictas, incluido el libro de control de psicotrópicos.

Checklist de trámites sanitarios

Trámite / requisito	Para qué / cuándo aplica
Aviso de Funcionamiento (COFEPRIS)	Habilita el domicilio como establecimiento con actividad de riesgo sanitario. Aplica a toda farmacia.
Aviso de Responsable Sanitario	Designa a la persona responsable del manejo correcto de medicamentos. Acompaña al aviso de funcionamiento.
Licencia Sanitaria	Permiso más estricto. Aplica si vas a manejar estupefacientes o psicotrópicos (controlados).
Registro/control de controlados	Libro de control y registros que exige el manejo de medicamentos de fracción, como el tramadol desde julio 2026.
Trámite en DIGIPRIS	Portal en línea donde hoy se presentan muchos de estos trámites sanitarios.
Uso de suelo y permisos municipales	Aparte de COFEPRIS: los tramitas en tu municipio/estado. Varían por localidad.

El orden práctico para no perder tiempo

Un error común es querer avanzar todo a la vez o dejar los trámites sanitarios para el final, cuando el local ya está rentado y corriendo gastos. El orden razonable es: primero confirma el uso de suelo y los permisos municipales del local (porque si ese domicilio no puede ser farmacia, lo demás no sirve); luego define quién será tu responsable sanitario; después presenta el Aviso de Funcionamiento junto con el de Responsable Sanitario en DIGIPRIS; y, si vas a manejar controlados, contempla desde el inicio la Licencia Sanitaria y sus obligaciones de registro, porque es la parte que más planeación pide. Si quieres una visión general de qué exige la autoridad ya operando, revisa cómo cumplir con COFEPRIS en tu farmacia.

Abrir en regla también es cómo operas desde el día 1

Sacar los permisos es la mitad del asunto; la otra mitad es operar de forma que puedas demostrar orden cuando la autoridad lo pida. Un negocio que desde su primer día registra bien sus ventas, controla existencias y caducidades, emite CFDI y —si maneja controlados— lleva su libro de control al día, llega tranquilo a cualquier revisión. Los trámites te abren la puerta; la operación diaria es la que te mantiene en regla.

Preguntas frecuentes

¿Qué permisos necesito para abrir una farmacia?
En la parte sanitaria, toda farmacia presenta ante COFEPRIS el Aviso de Funcionamiento junto con el Aviso de Responsable Sanitario, hoy en muchos casos a través de DIGIPRIS. Si vas a manejar medicamentos controlados (estupefacientes o psicotrópicos), además necesitas Licencia Sanitaria. Aparte van los permisos municipales como el uso de suelo. Confirma cada requisito en el portal oficial.

¿Necesito licencia sanitaria o basta el aviso de funcionamiento?
Depende de qué vayas a vender. Para venta libre y de receta común, el Aviso de Funcionamiento y el de Responsable Sanitario cubren el arranque. Si vas a manejar estupefacientes o psicotrópicos, el requisito sube a Licencia Sanitaria, que es un permiso más estricto. Por ejemplo, el tramadol es controlado de Fracción III desde el 14 de julio de 2026.

¿El uso de suelo se tramita en COFEPRIS?
No. El uso de suelo y otros permisos municipales o estatales se gestionan ante tu ayuntamiento o gobierno local, no ante COFEPRIS. Son trámites aparte de los sanitarios y varían según la ciudad, por lo que conviene revisarlos antes de rentar el local.